Відсутньою ланкою в переході коронавірусу від кажанів до людей можуть бути панголіни, а не змії
Послідовності білків вірусу у хворих панголінів на 91% ідентичні білкам людського вірусу та ще є деяка схожість.
Про це розповідають в Американському хімічному товаристві.
Поки вчені намагаються дізнатись більше про коронавірус SARS-CoV-2, два останні дослідження геному вірусу дійшли до суперечливих висновків: а саме, що змії є проміжними господарями нового вірусу, і, що ключовий коронавірусний білок має "нечувану схожість" з білком HIV-1 (вірус імунодефіциту людини). Зараз дослідження, описане в "Журналі досліджень протеомів" Американського хімічного товариства, спростовує обидві ідеї та припускає, що лускаті тварини, схожі на мурахоїдів, звані панголінами, є недостаючою ланкою передачі SARS-CoV-2 між кажанами та людьми.
Розуміння того, звідки походить SARS-CoV-2 -- вірус, що спричинив пандемію COVID-19 -- і як він поширюється, має важливе значення для його контролю та лікування. Більшість експертів сходяться на думці, що природним резервуаром SARS-CoV-2 є кажани, але для того, щоб перейти від кажанів до людини, був необхідний проміжний господар. Нещодавно проведене дослідження, яке проаналізувало геном нового вірусу, запропонувало змій у якості цього господаря, незважаючи на те, що коронавіруси, як відомо, заражають лише ссавців та птахів. Тим часом, неспоріднене дослідження порівняло послідовність шиповидного білка -- ключового білка, відповідального за потрапляння вірусу в клітини ссавців -- у нового коронавірусу та вірусу HIV-1, відмітивши несподівану подібність. Хоча автори відкликали препринт цього манускрипту після наукової критики, він породив чутки та теорії змови про те, що новий коронавірус міг бути розроблений у лабораторії. Ян Чжан та його колеги захотіли провести більш ретельний та повний аналіз ДНК SARS-CoV-2 та послідовностей його білків для вирішення цих питань.
Порівняно з попередніми дослідженнями, вчені використовували більші набори даних та новіші, більш точні методи біоінформатики та бази даних для аналізу геному SARS-CoV-2. Вони виявили, що, на відміну від твердження про те, що чотири ділянки шиповидного білка унікально розподілені між SARS-CoV-2 та HIV-1, чотири сегмента послідовностей можна знайти в інших вірусах, включаючи коронавірус кажана. Виявивши помилку в аналізі, яка запропонувала змій як проміжних господарів, група шукала ДНК та білкові послідовності, виділені з тканин панголіна, на предмет подібних до SARS-CoV-2.
Дослідники виявили послідовності білків у легенях хворих тварин, які на 91% були ідентичні білкам людського вірусу. Більше того, ділянка зв′язування рецептора шиповидного білка коронавірусу панголіна має лише п′ять відмінностей в амінокислотах від SARS-CoV-2, порівняно з 19 різницями між білками вірусів людини та кажана. Це свідчить про те, що панголін є найбільш вірогідним проміжним господарем нового коронавірусу, але можуть бути можливими додаткові проміжні господарі, кажуть дослідники.