Недостающим звеном в переходе коронавируса от летучих мышей к людям могут быть панголины, а не змеи

Последовательности белков вируса у больных панголинов на 91% идентичны белкам человеческого вируса и есть еще некоторое сходство.

Об этом рассказывают в Американском химическом обществе.

Пока ученые пытаются узнать больше о коронавирусе SARS-CoV-2, два последних исследования генома вируса пришли к противоречивым выводам: а именно, что змеи являются промежуточными хозяевами нового вируса, и, что ключевой коронавирусный белок имеет "неслыханное сходство" с белком HIV-1 (вирус иммунодефицита человека). Сейчас исследования, описанное в "Журнале исследований протеомов" Американского химического общества, опровергает обе идеи и предполагает, что чешуйчатые животные, похожие на муравьедов, называемые панголины, являются недостающие звеном передачи SARS-CoV-2 между летучими мышами и людьми.

Понимание того, откуда происходит SARS-CoV-2 -- вирус, вызвавший пандемию COVID-19 -- и как он распространяется, имеет важное значение для его контроля и лечения. Большинство экспертов сходятся во мнении, что естественным резервуаром SARS-CoV-2 являются летучие мыши, но для того, чтобы перейти от летучих мышей к человеку, был необходим промежуточный хозяин. Недавно проведенное исследование, которое проанализировало геном нового вируса, предложило змей в качестве этого хозяина, несмотря на то, что коронавирусы, как известно, заражают только млекопитающих и птиц. Между тем, неродственное исследование сравнило последовательность шиповидного белка -- ключевого белка, ответственного за попадание вируса в клетки млекопитающих -- у нового коронавируса и вируса HIV-1, заметив неожиданное сходство. Хотя авторы отозвали препринт этого манускрипта после научной критики, он породил слухи и теории заговора о том, что новый коронавирус мог быть разработан в лаборатории. Ян Чжан и его коллеги захотели провести более тщательный и полный анализ ДНК SARS-CoV-2 и последовательностей его белков для решения этих вопросов.

По сравнению с предыдущими исследованиями, ученые использовали большие наборы данных и новые, более точные методы биоинформатики и базы данных для анализа генома SARS-CoV-2. Они обнаружили, что, в отличие от утверждения о том, что четыре участка шиповидного белка уникально распределены между SARS-CoV-2 и HIV-1, четыре сегмента последовательностей можно найти в других вирусах, включая коронавирус летучей мыши. Обнаружив ошибку в анализе, которая предложила змей в качестве промежуточных хозяев, группа искала ДНК и белковые последовательности, выделенные из тканей панголина на предмет подобных SARS-CoV-2.

Исследователи обнаружили последовательности белков в легких больных животных, которые на 91% были идентичны белкам человеческого вируса. Более того, участок связывания рецептора шиповидного белка коронавируса панголина имеет только пять отличий в аминокислотах от SARS-CoV-2, по сравнению с 19 разницам между белками вирусов человека и летучей мыши. Это свидетельствует о том, что панголины является наиболее вероятным промежуточным хозяином нового коронавируса, но могут быть возможны дополнительные промежуточные хозяева, говорят исследователи.